1. Я привык делать несколько документов одновременно. Или, например, просматривать отчет по движению товара и одновременно делать накладную (счет). Программа этого не позволяет. Обидно. Кстати, 1С это позволяет 
2. Есть отдельный кладовщик, который занимается проведением товаров. Как сделать операцию по проведению товара доступной только кладовщику? При этом он не имеет правда создавать накладные и корректировать их.
1. Просматривать отчет по движению товара и одновременно делать накладную вы можете, при выписке накладной нажмите на кнопку F6 (история движения товара). Так исторически сложилось что программа работает в модальном режиме, и переделать ее очень не выгодно, будет затрачено намного больше усилий чем написать программу с нуля. Также это может только запутать программу, чтобы не хотелось, второй 1С мы не хотим создавать.
2. Меню Опции:Права пользователей. Там можно ограничить права на разные действия.